EM菌原液滲入水體后，其群體作用能殺死或抑制病原微生物和有害物質(zhì)，調(diào)整養(yǎng)殖生態(tài)環(huán)境，增加水中溶氧量（氧氣），促進(jìn)養(yǎng)殖生態(tài)系中的正常菌群和有益藻類活化生長(zhǎng)，保持養(yǎng)殖水體的生太平衡；拌入餌料投喂，直接增強(qiáng)魚類的吸收功能和防病抗逆能力，促進(jìn)健壯生長(zhǎng)。EM菌原液中的光合菌還能利用水中的硫化氫、有機(jī)酸、氨及氨基酸兼有反硝化作用中去除水中的亞硝酸銨，因而能使養(yǎng)殖池中的排泄物和殘餌污染得到凈化，改善水質(zhì)，減少魚病。主要作用為：
     1、減少病原微生物和不良藻類、明顯增強(qiáng)養(yǎng)殖對(duì)象的免疫力和抗病性，降低發(fā)病率，提高成活率。用戶反映，EM菌原液可使蟹苗成活率提高近一倍，中華石斑魚的成活率由原來的30%提高到70%以上。
     2、增加有益微生物數(shù)量。水面浮游動(dòng)物、有益藻類增多，特別是紅蟲不斷增多至布滿水面。
     3、穩(wěn)定和改善水質(zhì)，水體顏色清爽，不臭不腐，無硫化氫、氨氣等異味，能見度在25－50cm的時(shí)間長(zhǎng)且較穩(wěn)定，換水時(shí)間可延長(zhǎng)2倍以上。
     4、魚蝦糞、池底雜質(zhì)和下腳料不會(huì)變成淤泥而呈散沙狀。
     5、促進(jìn)生長(zhǎng)，增重率明顯提高。實(shí)踐證明，在同等環(huán)境下，用EM菌原液后，可提前10－15天上市，平均畝產(chǎn)提高20%－35%，產(chǎn)卵量增加25%，產(chǎn)卵時(shí)間延長(zhǎng)。有的試驗(yàn)表明，常溫新鱉池用EM菌原液后，產(chǎn)卵時(shí)間延長(zhǎng)近70天，且孵化率較好，餌料不臭，改善了養(yǎng)殖環(huán)境。北京郊區(qū)某漁場(chǎng)在魚苗試驗(yàn)中，試驗(yàn)組魚苗體重為對(duì)照組的兩倍，廈門某學(xué)院在小面積對(duì)蝦養(yǎng)殖試驗(yàn)中，體重增重率達(dá)166.7%。